1、有境外（含港澳台）控股或直接投资的公司不能申请军工保密资质。
鉴于股东对企业经营信息有基本的知情权，为避免境外投资股东及其指定的企业经营管理人员知悉、接触国家秘密信息，确保国家秘密安全，《办法》对申请单位的股权结构做出了明确规定。申请单位不能有外商（含港澳台）控股或直接投资。
2、通过间接方式投资的外方投资者及其一致行动人的出资比例超过20%的公司不能办理军工保密资质。
注意：这里说的外方投资者不是指外资。
间接投资是指通过购买公司股票、公司债券、衍生证券等金融工具，依靠股息、利息及买卖差价实现资本增值，而对企业经营活动不主动施加影响的投资方式。一致行动人是指在证券交易和股东投票权行使过程中，通过协议或者其他安排共同扩大其所能支配的股权表决权数量的多个投资者。
3、法定代表人、主要负责人、实际控制人、董（监）事会人员、高级管理人员以及承担或者拟承担涉密武器装备科研生产任务的人员必须为中华人民共和国国籍，无境外永久居留权或者长期居住许可，与境外（含港澳台）人员无婚姻关系，否则不能申请军工保密资质。
专家提醒：在实际申请军工保密资质的过程中，不仅只考察配偶，还会对家庭主要人员都会调查，如子女在境外留学、长期居住等情况都会在考虑范围之内。
4、没有承担或者拟承担涉及国家秘密的武器装备科研生产项目、产品的企业不能办理军工保密资质。
关于这一点，在咨询的客户当中有50%的企业是不知道的，只是看别人有这个资质就想办理，孰不知还需要那么多限制的条件。
专家提醒：如果项目或产品仅背景、用途、数量涉密的，也不需要申请武器装备科研生产单位保密资格。
5、成立时间不到三年的企业，不能申请军工保密资质。
注意：网上有传成立不到三年也可以办理军工保密资质，在此专家辟谣，对民企来说成立不满三年不能办理军工保密资质，这个是硬性指标。但也有军方特批的情况存在，比如军方急需，又恰好您的产品是国内独家或国际领先的企业不满三年也是可以办理军工保密资质的。但是很少有民企能够满足这个要求。
6、代理公司或经销商且不具备生产研发能力的企业不能申请军工保密资质。
接到的咨询中有一些代理公司的相关咨询，细聊之下发现他们之前和军方也有过合作，这才想要办理军工保密资质。
军方在急需某一种产品时，对一些不涉密且数量不多的产品也会在经销商中进行采购，并不要求企业具有保密资质。但是经销商企业想要办理军工保密资质就必须具备有研发能力或者具备生产能力之后才能办理军工保密资质。
以上只是列举的六种明确规定的不能办理军工保密资质的企业类型，其实在申请过程中还有更多的要求。
军工武器装备科研资质认证有哪些资质申请？
军工涉密业务条件备案
军工保密资格认证
军工质量管理体系认证
武器装备科研生产许可申请
装备承制单位资格审查
全军武器装备采购信息网入库
军队采购网上商城入库
军队采购网入库
国防专利代理申请
涉密信息系统集成资质（国密资质）
